Sau những màn trình diễn ấn tượng trong màu áo U19 Việt Nam năm 2013 và 2014, Công Phượng đã được HLV Miura gọi vào đội U23 Việt Nam. Thực tế ở những giải đấu đã qua, chân sút xứ Nghệ đều chơi khá hay, đặc biệt là tại vòng loại U23 châu Á 2016 trên đất Malaysia hồi tháng 3. Ngay cả khi đội nhà chơi không tốt tại SEA Games 28 khi chỉ có tấm huy chương đồng an ủi thì đó vẫn có thể coi là thành công với cá nhân Công Phượng.
Công Phượng có quá ít cơ hội đá chính tại ĐT Việt Nam.
Đóng vai trò trụ cột ở đội trẻ nhưng CP10 lại chưa từng có dịp được khoác áo ĐT Việt Nam ở trận đấu chính thức nào. Trước thềm trận mở màn vòng loại World Cup 2018 gặp chủ nhà Thái Lan hồi cuối tháng 5, chân sút 20 tuổi từng được HLV người Nhật đôn lên tập luyện cùng các đàn anh. Tuy nhiên đến khi đội bóng lên đường sang xứ sở chùa vàng, Công Phượng lại bất ngờ bị gạch tên, bất chấp đã thể hiện khá tốt trong những buổi tập trước đó.
Góp mặt trong thành phần của ĐT Việt Nam đấu giao hữu với Man City ngày 27/7 mới là lần đầu tiên Công Phượng được gọi lên “đội lớn” trong sự nghiệp cầu thủ. Và như tất cả đã thấy ngôi sao của HAGL chỉ xuất hiện trong sân vỏn vẹn 5 phút và chẳng để lại dấu ấn nào đáng kể bởi thời gian là quá ít.
Trước sự chỉ trích của người hâm mộ nhằm vào mình khi cho rằng lẽ ra nên sử dụng Công Phượng sớm hơn khi đối đầu đội bóng đến từ nước Anh, HLV Miura mới đây đã đăng đàn khẳng định ông có lý để làm vậy. Cụ thể chiến lược gia người Nhật nói mình không muốn mạo hiểm với tình trạng thể lực của cậu học trò vì trước đó Công Phượng có dấu hiệu bị quá tải khi phải “cày ải” liên tục ở HAGL.
Những lời giải thích của HLV Miura cho thấy trong mắt của thầy Nhật, Công Phượng chỉ được nhìn nhận ở mức bình thường, chứ chưa phải là bất khả xâm phạm.