Bất chấp đánh bại Atletico với tỷ số 2-1 trong trận tái đấu trên sân nhà Allianz Arena (hòa 2-2) nhưng chung cuộc Bayern vẫn bị loại do luật bàn thắng trên sân khách. Đã có hàng loạt tình huống gây tranh cãi từ các quyết định từ trọng tài chính người Thổ Nhĩ Kỳ, Cuneyt Cakir. Thất vọng vì Bayern bị loại, GĐĐH Karl-Heinz Rummenigge của đội chủ nhà đã đăng đàn chỉ trích tổ trọng tài khi cho rằng Hùm xám đã bị xử ép trong 2 pha bóng quyết định (bàn thắng của Griezmann và quả 11m của Torres).
Bayern dừng bước ở bán kết Champions League.
"Bayern cảm thấy như bị lừa dối. Tình huống ghi bàn của Atletico rõ ràng không hợp lệ. Ai cũng thấy Griezmann đã rơi vào thế việt vị nhưng trọng tài vẫn công nhận nó. pha Phạm lỗi của Javi Martinez với Fernando Torres cũng diễn ra ngoài vòng cấm địa xong Atletico vẫn được hưởng 11m. Tôi không thể hiểu nổi quyết định của trọng tài", sếp lớn của đội chủ nhà công kích mạnh mẽ.
Rummenigge cũng thể hiện sự ngạc nhiên và hoài nghi về cách bố trí trọng tài điều khiển trận đấu của UEFA: "Tôi không hiểu sao trọng tài Cuneyt Cakir lại được giao nhiệm vụ điều khiển 2 trận đấu chỉ trong 7 ngày (tuần trước, vị vua sân cỏ này đã được phân công bắt trận Man City tiếp Real tại lượt đi bán kết Champions League). Tôi không biết các trọng tài khác của UEFA có phải cầm còi nhiều đến thế không. Sau trận một người đại diện của UEFA đã thẳng thắn nói với tôi rằng: Thật xấu hổ với những gì trọng tài làm hôm nay".
Trong khi đó tiền đạo Thomas Mueller lại tỏ ra thất vọng với bản thân sau khi đá hỏng quả phạt đền cho Bayern. Nếu ngôi sao người Đức thành công ở pha bóng đó mọi chuyện có lẽ sẽ khác. "Bóng đá đôi lúc rất khắc nghiệt. Chúng tôi hầu như đã làm rất tốt và chỉ có một ít sai lầm. Song, Bayern phải trả giá vì điều đó. Tôi rất buồn vì không thể giúp đội nhà vào chung kết. Bản thân đã chứng kiến những kịch bản thế này