Sau khi mở đầu phần tranh tụng, Viện kiểm sát (VKS) bắt đọc đầu bản luận tội và nêu mức án đề nghị. VKS nhận định, 6 bị cáo Sơn, Tuấn, Dũng, Ánh... tại phiên tòa đã khai nhận thành khẩn. Dù bị cáo Trọng không nhận tội, nhưng căn cứ kết quả thẩm vấn ông Dũng và những người khác, VKS đủ cơ sở kết luận ông Trọng đã hướng dẫn cho anh trai trốn tại nhà bạn gái của mình.
Ông Trọng đã gọi Sơn bàn bạc kế hoạch đưa ông Dũng ra nước ngoài với sự trợ giúp của Thắng, Tuấn, Ánh, Dũng "Bắc Kạn". Dưới sự chỉ đạo của ông Trọng, một số đồng nghiệp cấp dưới cùng bạn bè đã đưa ông Dũng từ Hà Nội về Quảng Ninh rồi vào TP HCM rồi sang Campuchia, Singapore. Đây là vụ án nghiêm trọng, các bị cáo sử dụng thủ đoạn tinh vi để qua mặt cơ quan chức năng.
Viện kiểm sát đề nghị phạt Dương Tự Trọng từ 18-20 năm tù.
Bị cáo Trọng là chủ mưu, là người cung cấp tiền cho anh trai để trốn truy nã. Bị cáo Sơn bị đánh giá có vai trò sau ông Trọng. Tuy nhiên đã thành khẩn khai nhận, nhân thân tốt, nhiều bằng khen trong công tác nên đề nghị xem xét giảm nhẹ một phần hình phạt.
Đồng Xuân Phong thực hiện tội phạm một cách tích cực, nhiều lần sang Campuchia tiếp tế cho Dương Chí Dũng trong khi bản thân mình cũng đang vi phạm pháp luật, phải trốn tránh.
Trần Văn Dũng đã đưa Dương Chí Dũng trót lọt qua cửa khẩu Mộc Bài, đã sang Campuchia thu xếp việc ăn ở cho Dương Chí Dũng, thể hiện tính chất coi thường pháp luật.
Phạm Minh Tuấn – bạn thân của Dương Tự Trọng đã đi Hà Nội đón Dương Chí Dũng từ nhà chị N. ở Cầu Giấy, Hà Nội vì biết nhà chị này, đưa đi Quảng Ninh trốn nhưng thành khẩn khai báo, hành động vì tình cảm, có thể xem xét giảm nhẹ một phần hình phạt.
Việc miễn trách nhiệm hình sự cho Nguyễn Hồng Vinh (em rể Dương Tự Trọng), VKS nhận định là có cơ sở, phù hợp, cần chấp nhận.
Hành vi làm giả hộ chiếu, một số giấy tờ khác của Đồng Xuân Phong, Bộ Công an đã chuyển cho Công an Hải phòng xem xét xử lý.
Từ phân tích nhận định này, Đại diện VKS đề nghị Dương Tự Trọng (53 tuổi, nguyên phó giám đốc Công an TP Hải Phòng, nguyên phó cục trưởng Cục Cảnh sát quản lý hành chính về trật tự xã hội - Tổng cục VII - Bộ Công an) mức án 18 - 20 năm tù. Với Vũ Tiến Sơn (48 tuổi, nguyên phó trưởng phòng cảnh sát điều tra tội phạm về trật tự xã hội, Công an TP Hải Phòng) VKS đề nghị mức án 17 - 18 năm tù. Hoàng Văn Thắng ; Đồng Xuân Phong; Trần Văn Dũng và Nguyễn Trọng Ánh cùng bị đề nghị mức án 6 - 7 năm tù. Riêng bị cáo Phạm Minh Tuấn bị đề nghị ở mức 5 - 6 năm tù.
Với lời khai của nhân chứng Dương Chí Dũng tại tòa, đại diện VKS đề nghị cơ quan chức năng khởi tố vụ án để điều tra hành vi Cố ý làm lộ bí mật công tác. Đưa và nhận hối lộ tại Tổng công ty Vinalines cũng như ép cung, mớm cung VKS kiến nghị cơ quan điều tra có thẩm quyền làm rõ theo pháp luật.
Văn Nguyễn