Chỉ sản xuất trong khoảng từ 1998 - 1999, có tổng cộng 20 chiếc CLK GTR phiên bản mui kín đã được Mercedes xuất xưởng. Ngoài ra, Mercedes còn tạo ra 6 chiếc bản mui trần, 2 phiên bản thử nghiệm và 7 bản đua. Vào thời điểm đó, CLK GTR đã được sách kỷ lục Guinness ghi nhận là chiếc xe đắt nhất Thế giới với giá 1,547 triệu USD.