Trước đó, vào sáng cùng ngày các em đi tổ chức sinh nhật bạn rồi cùng nhau đi chơi, câu cá ở Thác Chuối, sau đó về tắm ở ngầm Cờ đỏ.
Đến 17h cùng ngày, một người bạn học đi qua trên cầu thấy áo quần, điện thoại và xe đạp dưới chân cầu, nhận ra của bạn mình nên xuống tìm nhưng không thấy, sau đó đã về báo với gia đình của các bạn trên.
Ngay khi nhận được tin báo, gia đình, địa phương đã phối hợp với các lực lượng chức năng (Công an huyện Bố Trạch, Phòng Cảnh sát Phòng cháy chữa cháy và Cứu hộ cứu nạn, Công an tỉnh…) khẩn trương triển khai các phương án tìm kiếm 3 học sinh.
Đến 23h22 cùng ngày, các lực lượng chức năng đã tìm thấy thi thể học sinh Trần Đức T, cách cầu Ngầm Cờ Đỏ khoảng 100m; tiếp đó khoảng 20 phút, tìm thấy thi thể học sinh Lê Phạm Ngọc C; thi thể học sinh Phạm Hồng N được tìm thấy vào lúc gần 1h ngày 28/6.
Hiện, thi thể 3 học sinh đã được gia đình đưa về mai táng theo phong tục địa phương.